草莓经过脱毒后，是否达到了脱毒效果或是否脱毒彻底，需要经过严格的脱毒鉴定才能确定。
脱毒鉴定的常用方法一般有以下3种：
病毒指示植物鉴定法：
具体说来就是用对草莓病毒特别敏感的品种或品系，进行接种鉴定。目前日本、美国和欧洲国家都先后研制出了各种病毒的敏感品系作为各种病毒的指示植物，例如对草莓斑驳病毒特别敏感的品种或品系，对草莓黄边病毒特别敏感的品种或品系，对草莓镶脉病毒特别敏感的品种或品系和对草莓皱缩病毒特别敏感的品种或品系。用这些各种病毒的敏感品系就能鉴定出脱毒效果。
电子显微镜镜检法：
草莓的各种病毒都有一定的形态特征，有些是杆状、线状或点状等,而且其长度、宽度也不一样,因此利用病毒特定的形态特征，就可以在电子显微镜下进行病毒的鉴定工作。为了防止漏检，应尽量多做切片，同时大量检测才确实可靠。
血清免疫鉴定法：
这种方法需要有特定病毒的抗体，一般可委托技术力量较强的科研单位进行。
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